Titre :
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Le séquençage haut-débit : Vers un diagnostic basé sur la séquence complète du génome de l’agent infectieux
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Revue :
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médecine/sciences (m/s), 30, 12
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Auteurs :
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Audebert C ;
Hot D ;
Lemoine Y ;
Caboche S
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Type de document :
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Article
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Année de publication :
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2014
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Pages :
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p 1144
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Langues:
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Français
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Mots-clés :
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article de type review
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Bactéries
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diagnostic
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infectiologie
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séquençage
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Virus
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Résumé :
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Lors d’une infection, l’identification précise de l’agent infectieux est de première urgence. Après les méthodes phénotypiques qui restent largement employées, la biologie moléculaire a fait son entrée dans les laboratoires de microbiologie clinique, permettant l’identification du pathogène par la comparaison de son empreinte moléculaire à une banque de données. Le séquençage haut-débit permettrait de dépasser cette seule identification en exploitant la totalité de la connaissance du génome du pathogène. Ce passage de l’empreinte au portrait-robot, soutenu par un nombre croissant d’études préliminaires, permettrait une meilleure adaptation du traitement aux spécificités du pathogène. Cependant, plusieurs obstacles doivent être franchis afin que l’exploitation des données de séquençage haut-débit devienne une réalité.
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Lien associé :
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Lien vers le texte complet sur le site "médecine/sciences"
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Pubmed / DOI :
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DOI : 10.1051/medsci/20143012018 / Pubmed : 25537045
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En ligne :
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http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25537045
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