Résumé :
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Le but de cette thèse est la mise au point de méthodes de cartographie physique du génome humain, et plus particulièrement de construction d'une banque de clones ordonnée. Elle comprend donc d'abord une introduction aux objets et techniques de biologie moléculaire utilisés pour la cartographie physique. La problématique de l'ordonnancement de banques de clones est ensuite décrite, avec un aperçu des techniques de clonage et d'ordonnancement pertinentes. Dans la troisième partie, les principaux efforts de construction de banque ordonnée conduits préalablement à la thèse sont étudiés. Les conclusions que nous en avons tiré, complétées par celles de nos premiers travaux, sont alors rappelées : utilisation préférentielle de chromosomes artificiels de levure, d'une banque génomique (par opposition à des banques chromosome-spécifiques) et de techniques d'empreinte de restriction. Puis la quatrième partie propose une reformulation plus abstraite du problème d'ordonnancement considéré, qui facilite l'identification des méthodes et algorithmes susceptibles d'aider à sa résolution. Les développements (tant biologiques qu'informatiques) conduits pour les besoins du projet de cartographie physique de Généthon sont alors décrits. La sixième partie résume les résultats obtenus après analyse de 33000 clones, ainsi que les conclusions que l'ont peut tirer sur leur qualité au vu du criblage par plusieurs centaines de marqueurs polymorphes. Enfin, la dernière partie propose une réévaluation des choix effectués et un aperçu des perspectives ouvertes.
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