Titre : | Cartographie des sites d'insertions d'un vecteur dérivé du VIH-1 : mise au point d'une technique à haut débit |
Auteurs : | Mantovani-Bourgey J, Auteur |
Type de document : | Thèse/Mémoire |
Année de publication : | 2007 |
Pages : | 241 p |
Langues: | Français |
Mots-clés : | bioinformatique ; biologie cellulaire ; biologie moléculaire ; carte génomique ; cellule cible ; génome ; mutagenèse dirigée ; recherche biomédicale ; rétrovirus ; syndrome de Wiskott-Aldrich ; thérapie génique ; transfert de gène ; vecteur lentiviral |
Résumé : |
Une étape majeure du cycle de vie des rétrovirus est leur intégration dans le génome de la cellule hôte. Cette propriété a été avantageusement utilisée pour le développement de vecteurs de thérapie génique qui permettent une expression stable du transgène même après un certain nombre de divisions cellulaires. Néanmoins, l’utilisation de ces vecteurs a également révélé un risque lié à la mutagénèse insertionnelle.
L’évaluation de ce risque passe par l’analyse de la distribution des sites d'intégration. J’ai développé une technique d’identification à «haut débit» des sites d'insertion d’un vecteur dérivé du VIH-1. Cette nouvelle technique appelée VITA, Vector Integration Tag Analysis, génère des étiquettes génomiques de 21 et 22 pb à proximité d’un site d'insertion. Leur concaténation permet d’augmenter le débit d’analyse des techniques existantes. Ce travail décrit la mise au point et la validation de la technique ainsi que les résultats de son application dans un projet pré-clinique. |
Type de thèse : | Thèse |